Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Psmd1Q3TXS7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psmd1Q3TXS7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psmd1Q3TXS7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psmd1Q3TXS7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms