Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rtl9Q32KG4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtl9Q32KG4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtl9Q32KG4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms