Protein–RNA interactions for Protein: Q2WG77

Ripply1, Protein ripply1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply1Q2WG77 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripply1Q2WG77 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripply1Q2WG77 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripply1Q2WG77 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms