Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdgfl1Q2VPR5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdgfl1Q2VPR5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdgfl1Q2VPR5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms