Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim71Q1PSW8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim71Q1PSW8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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