Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc39dQ0VF76 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc39dQ0VF76 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc39dQ0VF76 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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