Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam83bQ0VBM2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam83bQ0VBM2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam83bQ0VBM2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam83bQ0VBM2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam83bQ0VBM2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam83bQ0VBM2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam83bQ0VBM2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam83bQ0VBM2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam83bQ0VBM2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam83bQ0VBM2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam83bQ0VBM2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam83bQ0VBM2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fam83bQ0VBM2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms