Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt80Q0VBK2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt80Q0VBK2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt80Q0VBK2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms