Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab42Q0PD08 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab42Q0PD08 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab42Q0PD08 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms