Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32,49■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32,49■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32,47■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32,45■■■□□ 2,79
Vps8Q0P5W1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,45■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,41■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32,39■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Vps8Q0P5W1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32,33■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Vps8Q0P5W1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32,27■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32,26■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Vps8Q0P5W1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms