Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurl1bQ0MW30 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Neurl1bQ0MW30 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Neurl1bQ0MW30 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms