Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tgm3Q08189 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tgm3Q08189 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms