Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ebf1Q07802 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ebf1Q07802 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ebf1Q07802 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ebf1Q07802 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms