Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Col17a1Q07563 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Col17a1Q07563 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Col17a1Q07563 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Col17a1Q07563 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Col17a1Q07563 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Col17a1Q07563 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Col17a1Q07563 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Col17a1Q07563 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Col17a1Q07563 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Col17a1Q07563 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Col17a1Q07563 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Col17a1Q07563 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Col17a1Q07563 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Col17a1Q07563 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Col17a1Q07563 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Col17a1Q07563 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms