Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdx4Q07424 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdx4Q07424 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms