Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdf3Q07104 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Gdf3Q07104 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gdf3Q07104 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdf3Q07104 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms