Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Siah1bQ06985 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Siah1bQ06985 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Siah1bQ06985 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1bQ06985 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms