Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelbQ04863 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RelbQ04863 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelbQ04863 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RelbQ04863 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelbQ04863 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelbQ04863 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelbQ04863 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelbQ04863 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelbQ04863 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelbQ04863 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RelbQ04863 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RelbQ04863 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelbQ04863 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RelbQ04863 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelbQ04863 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelbQ04863 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RelbQ04863 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RelbQ04863 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RelbQ04863 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms