Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nf1Q04690 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nf1Q04690 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms