Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfiaQ02780 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NfiaQ02780 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NfiaQ02780 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NfiaQ02780 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms