Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna1cQ01815 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1cQ01815 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms