Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Grin2bQ01097 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Grin2bQ01097 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Grin2bQ01097 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Grin2bQ01097 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Grin2bQ01097 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Grin2bQ01097 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Grin2bQ01097 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Grin2bQ01097 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Grin2bQ01097 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Grin2bQ01097 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms