Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbp4Q00724 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbp4Q00724 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp4Q00724 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms