Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabpb1Q00420 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabpb1Q00420 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabpb1Q00420 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms