Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gbp10Q000W5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbp10Q000W5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp10Q000W5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gbp10Q000W5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136 ms