Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp9bP98195 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp9bP98195 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp9bP98195 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp9bP98195 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp9bP98195 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms