Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp2P97473 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tarbp2P97473 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tarbp2P97473 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms