Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhodP97348 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhodP97348 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhodP97348 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhodP97348 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhodP97348 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhodP97348 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhodP97348 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhodP97348 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhodP97348 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RhodP97348 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhodP97348 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhodP97348 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhodP97348 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhodP97348 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RhodP97348 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhodP97348 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhodP97348 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhodP97348 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhodP97348 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RhodP97348 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhodP97348 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhodP97348 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RhodP97348 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhodP97348 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhodP97348 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhodP97348 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhodP97348 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhodP97348 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhodP97348 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RhodP97348 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhodP97348 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhodP97348 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhodP97348 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhodP97348 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhodP97348 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhodP97348 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhodP97348 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RhodP97348 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhodP97348 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhodP97348 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RhodP97348 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhodP97348 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhodP97348 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhodP97348 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhodP97348 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhodP97348 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhodP97348 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RhodP97348 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhodP97348 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhodP97348 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RhodP97348 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhodP97348 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhodP97348 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhodP97348 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RhodP97348 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhodP97348 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RhodP97348 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RhodP97348 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RhodP97348 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RhodP97348 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RhodP97348 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhodP97348 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhodP97348 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RhodP97348 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RhodP97348 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhodP97348 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhodP97348 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhodP97348 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RhodP97348 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhodP97348 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhodP97348 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhodP97348 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RhodP97348 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhodP97348 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhodP97348 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhodP97348 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhodP97348 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhodP97348 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhodP97348 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RhodP97348 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RhodP97348 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhodP97348 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RhodP97348 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhodP97348 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhodP97348 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhodP97348 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RhodP97348 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhodP97348 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RhodP97348 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhodP97348 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhodP97348 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhodP97348 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhodP97348 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhodP97348 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhodP97348 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhodP97348 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhodP97348 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RhodP97348 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RhodP97348 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms