Protein–RNA interactions for Protein: P97288

Htr4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr4P97288 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr4P97288 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htr4P97288 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htr4P97288 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr4P97288 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr4P97288 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr4P97288 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr4P97288 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr4P97288 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr4P97288 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htr4P97288 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms