Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SgcgP82348 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcgP82348 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SgcgP82348 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgcgP82348 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgcgP82348 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgcgP82348 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SgcgP82348 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgcgP82348 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgcgP82348 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SgcgP82348 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SgcgP82348 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SgcgP82348 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcgP82348 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SgcgP82348 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms