Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx3P81067 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx3P81067 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx3P81067 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx3P81067 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irx3P81067 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx3P81067 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Irx3P81067 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx3P81067 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx3P81067 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms