Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf3P70671 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf3P70671 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf3P70671 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf3P70671 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irf3P70671 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf3P70671 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irf3P70671 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf3P70671 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf3P70671 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irf3P70671 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms