Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rad50P70388 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rad50P70388 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rad50P70388 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rad50P70388 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rad50P70388 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad50P70388 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rad50P70388 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad50P70388 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rad50P70388 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad50P70388 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad50P70388 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad50P70388 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad50P70388 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rad50P70388 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rad50P70388 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad50P70388 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rad50P70388 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms