Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ufd1P70362 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ufd1P70362 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ufd1P70362 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ufd1P70362 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms