Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Frat1P70339 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frat1P70339 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Frat1P70339 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frat1P70339 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frat1P70339 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frat1P70339 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frat1P70339 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Frat1P70339 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frat1P70339 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Frat1P70339 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms