Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema3eP70275 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema3eP70275 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema3eP70275 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms