Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SbdsP70122 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SbdsP70122 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SbdsP70122 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SbdsP70122 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SbdsP70122 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SbdsP70122 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SbdsP70122 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SbdsP70122 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SbdsP70122 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms