Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gabrb3P63080 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gabrb3P63080 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gabrb3P63080 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms