Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rps27aP62983 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps27aP62983 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps27aP62983 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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