Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabra1P62812 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gabra1P62812 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabra1P62812 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabra1P62812 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms