Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd3P62320 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snrpd3P62320 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms