Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmc5P62196 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmc5P62196 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmc5P62196 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmc5P62196 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmc5P62196 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmc5P62196 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmc5P62196 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms