Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmo4P61969 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmo4P61969 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lmo4P61969 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms