Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcmtd1P59913 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcmtd1P59913 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcmtd1P59913 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcmtd1P59913 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms