Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps5P59438 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hps5P59438 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hps5P59438 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps5P59438 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps5P59438 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps5P59438 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps5P59438 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps5P59438 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps5P59438 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps5P59438 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hps5P59438 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps5P59438 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps5P59438 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms