Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdrg1P59048 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdrg1P59048 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdrg1P59048 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdrg1P59048 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdrg1P59048 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdrg1P59048 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdrg1P59048 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdrg1P59048 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdrg1P59048 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdrg1P59048 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdrg1P59048 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdrg1P59048 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms