Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vps33bP59016 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vps33bP59016 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Vps33bP59016 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vps33bP59016 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms