Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tlr8P58682 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tlr8P58682 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tlr8P58682 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tlr8P58682 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms