Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paxbp1P58501 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paxbp1P58501 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxbp1P58501 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paxbp1P58501 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms