Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctdsp1P58466 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctdsp1P58466 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctdsp1P58466 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms